Решил настроить Symfony так, чтобы фаервол работал в ней от корня, но при этом были доступны страницы авторизации.
Первым делом, хочется сказать, что сделать это нельзя с помощью обычных настроек в app/config/security.yml А с помощью наследования от Symfony\Bundle\FrameworkBundle\Controller\Controller у меня не получилось, да и не красиво это. А можно это сделать с помощью написания своего ControllerListener-а.